Shawn decide di usare le sue abilità investigative quando il Capitano Conners, il vecchio superiore di suo padre Henry, che da tempo manifesta problemi di memoria, dichiara di aver risolto un vecchio caso di omicidio. Insieme all'amico Gus, Shawn scopre che il precedente delitto potrebbe essere collegato con la scomparsa di un giovane arrivato in città per incontrare i suoi genitori naturali.