Nella sesta stagione, la troupe si confronta con un volto familiare del passato che insiste sul fatto che le macchine non possono sostituire l’esperienza umana. Ciò causa un conflitto in Data che mette in dubbio la sua affiliazione con l'Enterprise rispetto all'unirsi a un potente nemico per provare la sua prima emozione. Worf inizia una ricerca per trovare suo padre come mezzo per accettare finalmente la sua eredità Klingon e per ripristinare l'onore della sua famiglia. Mentre il viaggio continua attraverso la galassia, Picard viene rapito da un comando alieno ribelle e Riker assume il ruolo di Capitano per liberare Picard e ripristinare l'Enterprise. Con sorpresa di Riker, un vecchio nemico ritorna e offre assistenza per il salvataggio di Picard. Tutto finisce con l'Enterprise che affronta la sua sorpresa più scioccante.